Sequoia HD 空间转录组解决方案

产品介绍

Sequoia HD 空间转录组产品 包含凝胶基高密度DNA芯片与专用的应用试剂,旨在精确检测切片组织中各区域细胞的转录组信息。该产品方案不仅提供卓越的分辨率,确保微小区域差异亦能清晰呈现,还具备出色的灵敏度,能够捕捉到低丰度转录本的信息,为您的研究提供详尽而可靠的数据支持。

芯片原理

Sequoia HD 空间转录组DNA芯片包含2500万个编码位置信息的捕获探针单元。该芯片利用光刻原位合成技术首先在硅片上合成高密度的DNA探针单元阵列,随后通过探针翻转技术将全长探针转移至水凝胶上,形成由2 x 2 µm 连续探针单元组成的凝胶芯片。每个探针单元都有一个精确的位置标识并能够特异性捕获RNA分子,从而实现对组织切片中基因表达的空间解析。

性能优势

全物种兼容
适用于全物种新鲜冷冻样本。
无偏全转录组捕获
利用探针 3’ 端的poly dT序列结合mRNA分子中普遍存在的polyA尾部,可在原理上实现对各种基因所产生mRNA的广泛捕获。
单细胞分辨率
利用 2 x 2 µm高分辨率条形码捕获单元获取转录本数据,可实现单细胞分辨率下的空间转录组分析。
无隙捕获探针阵列
通过连续无间隙排列的捕获探针单元,获取整张组织切片中高度完整的转录本信息。

案例展示

小鼠肝脏聚类与细胞注释

DOI:10.1101/2024.01.08.574734
小鼠肝脏聚类与细胞注释案例

小鼠脑示例

小鼠脑聚类结果案例

小鼠嗅球示例

小鼠嗅球聚类结果案例

应用场景

肿瘤微环境研究
免疫学
神经生物学
组织病理学
细胞与发育生物学

技术参数

捕获区域尺寸:10×10 mm
捕获探针单元形状及尺寸:正方形,2×2 μm
捕获探针单元间距:无
每个捕获单元探针数量:105数量级
捕获探针单元数量:2500万
序号名称反应数货号
1Sequoia HD 空间转录组芯片&试剂盒(FF)1 RXNs11001
产品说明书
产品宣传册
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