小鼠眼球示例

空间转录组分析 | 简约版

信息汇总

样本信息

物种类型 小鼠
组织类型 眼球
包埋方式 新鲜冷冻
RIN值 8.5

实验参数

试剂盒信息 v1.0
染色方法 H&E染色
透化时间 12 min
切片厚度 10 μm

测序分析

测序平台 illumina
总测序量 105.99 G

分析信息

分析软件版本 Sequoia-workflow v0.3.2
测序饱和度 64.38%

关键指标与聚类分析(Bin 10 μm)

52,632
组织下Bin数量
1,843.15
每个Bin平均Reads数
607.75
每个Bin平均UMI数
294.55
每个Bin平均基因数
空间聚类分析图