小鼠脑示例

空间转录组分析 | 简约版

信息汇总

样本信息

物种类型 小鼠
组织类型
包埋方式 新鲜冷冻
RIN值 8.2

实验参数

试剂盒信息 v1.0
染色方法 H&E染色
透化时间 20 min
切片厚度 10 μm

测序分析

测序平台 illumina
总测序量 448.23 G

分析信息

分析软件版本 Sequoia-workflow v0.0.1
测序饱和度 64.19%

关键指标与聚类分析(Bin 10 μm)

562,016
组织下Bin数量
1,733.79
每个Bin平均Reads数
494.86
每个Bin平均UMI数
93
每个Bin平均基因数
空间聚类分析图