Sequoia HD 靶向空间转录组解决方案

产品介绍

Sequoia HD 靶向空间转录组产品 包含凝胶基高密度DNA芯片与专用的应用试剂，旨在精确分析肿瘤生物学、肿瘤微环境和免疫反应。该产品采用连接探针原位杂交特异性捕获的方式，可同时以单细胞空间分辨率分析整个组织切片中755个泛癌基因的RNA表达。

产品特点

适用于肿瘤微环境分析及肿瘤发炎指数等分析
可自定义或补充额外靶点
可在同张切片进行H&E染色

分类	Annatiation	#Genes
癌细胞抗原释放	Release of Cancer Cell Antigens	27
癌抗原呈递	Cancer Antigen Presentation	26
T cell 启动和激活	T-cell Priming and Activation	41
肿瘤免疫细胞定位	Immune Cell Localization to Tumors	70
基质	Stromal Factors	37
T cell对癌细胞的识别	Recognition of Cancer Cells by T-cells	37
杀死肿瘤细胞	Killing of Cancer Cells	47
髓系细胞	Myeloid Cell Activity	65
NK细胞	NK Cell Activity	4
细胞周期与增值	Cell Cycle and Proliferation	20
肿瘤内在因素	Tumor-Intrinsic Factors	56
免疫代谢	Immunometabolism	30
常见信号通路	Common Signaling Pathways	52
内参基因	Internal Reference Genes	4

芯片原理

Sequoia HD 空间转录组DNA芯片包含2500万个编码位置信息的捕获探针单元。该芯片利用光刻原位合成技术首先在硅片上合成高密度的DNA探针单元阵列，随后通过探针翻转技术将全长探针转移至水凝胶上，形成由2 x 2 µm 连续探针单元组成的凝胶芯片。每个探针单元都有一个精确的位置标识并能够特异性捕获RNA分子，从而实现对组织切片中基因表达的空间解析。

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性能优势

单细胞分辨率
利用 2 x 2 µm高分辨率条形码捕获单元获取转录本数据，可实现单细胞分辨率下的空间转录组分析。
无隙捕获探针阵列
通过连续无间隙排列的捕获探针单元，获取整张组织切片中高度完整的转录本信息。

案例展示

结肠癌示例

结肠癌案例分析

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应用场景

捕获区域尺寸：10×10 mm

捕获探针单元形状及尺寸：正方形，2×2 μm

捕获探针单元间距：无

每个捕获单元探针数量：10^⁵数量级

捕获探针单元数量：2500万

序号	名称	反应数	货号
1	Sequoia HD 靶向空间转录组芯片&试剂盒（人泛癌panel ，FFPE）	1 RXNs	11002
2	Sequoia HD 靶向空间转录组芯片&试剂盒（人泛癌panel ，FF）	1 RXNs	11003

产品说明书

产品宣传册

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